La historia de Five Nights at Freddy's 2 profundiza el misterio que rodea a la serie, con minijuegos que se activan al morir y que ofrecen vistazos crípticos a la oscura historia del restaurante. Estas secuencias de estilo retro muestran escenas inquietantes, como niños atraídos por una figura sombría, lo que sugiere que se cometieron varios asesinatos en el lugar.